Базам mysql свойственно крашиться, и если у вас один сайт, то восстанавливать таблицы баз данных на обычном хостинге вам возможно и не придётся или придётся делать раз в год. А если сайтов у вас десятки то уследить за тем какая таблица «подвисла» и проверять какой сайт не работает уже сложнее.

Для того чтобы проверить, восстановить и оптимизировать все базы данных mysql достаточно подключить по ssh и выполнить команду:
mysqlcheck -uUSER -pPASSWORD --auto-repair --check --optimize --all-databases

Полезная команда, которая поможет вам проверить и восстановить все таблицы в ваших базах данных mysql:

mysqlcheck -uroot -ppassword --auto-repair --check --optimize --all-databases

Подключаемся к серверу по ssh и вводим вышеуказанную команду, заменяя только root — на имя пользователя и password — на пароль пользователя.